Om tegen verschillende monsters te vechten, moet je een speciaal leger creëren, dus in het spel Level Up Mutants ben je bezig met de selectie van verschillende soorten mutanten. Voor je op het scherm zie je het pad waarlangs je held rent. Door zijn run te controleren, vermijd je verschillende obstakels en vallen. Als u voorwerpen op de weg ziet liggen, raap ze dan op. Bestuurt het personage ook met behulp van groene krachtvelden. Dit zal je karakter veranderen en hem tot een mutant maken. Aan het einde van het pad wacht een monster op je om tegen je mutant te vechten. Als je monsters verslaat, verdien je punten in Level Up Mutants.